Depuis le début de ses activités, l’UPI a lancé un programme sectoriel dans l’agro-alimentaire qui varie de l’incitation à l’agriculture biologique, en passant par la promotion des investissements agro-industriels, jusqu’à l’introduction des systèmes de contrôles qualité et des procédures de traçabilité des plus récents. Depuis 2002, l’UPI organise annuellement une délégation d’entreprises tunisiennes pour SANA, la foire internationale de l’alimentation naturelle, de la Santé et de l’Environnement.  Dans le cadre de SANA 2006 (Italie, 7-10 Septembre 2006), l’UPI ONUDI Tunis a rempli sa mission, à savoir, d’aider les entrepreneurs Tunisiens à promouvoir tant leur société que le secteur bio agro alimentaire sur le marché Italien. Au cours de ces trois dernières années, l’UPI a mis en place divers ateliers de partenariat sur l’agro-industrie en Tunisie. Le Partenariat de Médenine, organisé  le 17 Mai 2006 en collaboration avec l'Agence de Promotion de l'Industrie (API) dans le gouvernorat de Médenine, a ainsi offert aux entreprises étrangères à la recherche d'opportunités de coopération industrielle  dans le sous-secteur de l’aquaculture un cadre idéal de rencontres interentreprises.